Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccer2J3QPU5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccer2J3QPU5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms