Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm2035J3QP87 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms