Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20918J3QN17 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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