Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930544D05RikJ3QK56 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930544D05RikJ3QK56 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms