Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn20G5E8X0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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