Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vmn1r58G3X9U3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms