Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf148G3X9R7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf148G3X9R7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf148G3X9R7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf148G3X9R7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf148G3X9R7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf148G3X9R7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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