Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nccrp1G3X9C2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms