Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim55G3X8Y1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim55G3X8Y1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms