Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ercc6F8VPZ5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms