Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gm28038F7BCN9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28038F7BCN9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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