Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms