Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crocc2F6XLV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms