Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28305F6U473 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms