Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmod3E9QA62 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms