Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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