Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arhgef5E9Q7D5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgef5E9Q7D5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms