Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BC005561E9Q5E2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BC005561E9Q5E2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms