Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Gm20518E9Q548 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms