Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NbasE9Q411 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NbasE9Q411 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms