Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
NebE9Q1W3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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