Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfp558E9Q1J0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp558E9Q1J0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms