Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdr1E9Q0B4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms