Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm3095E9Q058 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms