Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh10E9PXQ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh10E9PXQ7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms