Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sfta2E9PXB6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms