Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc62E9PVD1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc62E9PVD1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms