Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc175E9PVB3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc175E9PVB3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms