Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gcn1E9PVA8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gcn1E9PVA8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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