Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
BC035044E0CXF8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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