Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb3D3Z6J4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms