Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms