Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tgfbr3lD3YZZ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms