Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Rnf217D3YYI7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf217D3YYI7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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