Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kif28pD3YXS5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kif28pD3YXS5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms