Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc170D3YXL0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc170D3YXL0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms