Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd1D3YXK1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms