Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzd8B9EJ80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzd8B9EJ80 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzd8B9EJ80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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