Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Phf11cB4XVP9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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