Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Pnldc1B2RXZ1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pnldc1B2RXZ1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms