Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cped1B2RX70 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cped1B2RX70 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms