Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfap58B2RW38 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms