Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf3B2RUQ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usf3B2RUQ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms