Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PtprbB2RU80 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PtprbB2RU80 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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