Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpb1B2RS76 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms