Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp40B1B1D3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp40B1B1D3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms