Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms