Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scn3aA2ASI5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scn3aA2ASI5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms