Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rtf1A2AQ19 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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