Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syndig1A2ANU3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms